ETF与股票是两类完全不同的投资工具，主要体现在证券投资基金与股票的差别方面。作为证券投资基金的一种，ETF是一篮子证券的组合，与单一股票之间主要存在如下几点区别。
相比股票而言，ETF投资风险更分散
股票的投资风险比较集中，而ETF作为一篮子证券组合，其风险能在一定程度得到分散。根据有效市场理论和证券组合理论，投资者通过选择个股很难有效分散投资风险。而国外大量市场实践也证明，主动型投资理念并不能长期、稳定获得超越股票指数的收益。因此，从平衡风险与收益的角度看，投资者与其耗费大量精力、财力选择个股，倒不如投资ETF，实施指数化的投资者策略。
投资实践中，A股市场上有超过2600只股票，到底哪一只能够赚钱？蓝筹股相对成熟，容易研究，但获得的超额收益相对较少；中小股票常有黑马出现，但个股变脸的风险较大。选来选去往往错过时机，常常市场是涨的，自己却没赚多少钱，有的还“满仓踏空”。
相比股票而言，ETF投资成本更为低廉
在投资成本方面，主要看交易费用，若交易费率按万分之五来算，由于ETF交易免缴千分之一的印花税，那么买卖一来回ETF的费用（约为千分之一），可比买卖一来回股票的交易费用（约为千分之二）节约50%。
相比股票而言，ETF的投资效率更具优势
投资者当天买入的股票无法当天卖出，不能实现“T+0”交易。而对于ETF来说，大部分类型的ETF可以直接或间接实现“T+0”交易。如债券、黄金、货币、跨境类ETF已经实施“T+0”交易；单市场(仅沪市或深市)ETF、跨市场（跨沪深两市）ETF则可通过申购卖出和买入赎回间接实现“T+0”交易。
相比股票而言，ETF还增加了一级市场申购赎回的投资方式
ETF有一级市场申购赎回和二级市场交易两种投资方式，而股票上市后只能通过二级市场进行买卖。尽管股票和ETF的二级市场价格都会受到供求关系的影响，但ETF所具有的一、二级市场套利机制使其价格通常会紧密围绕基金份额实时净值波动，不会出现大的偏离。
相比股票而言，ETF投资范围更广泛
ETF根据投资标的属性不同而差异显著，投资者除了通过股票ETF投资股票资产外，还可以通过债券ETF投资债券市场，通过黄金ETF投资实物金，以及通过跨境ETF投资香港、美国、欧洲等境外市场。
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