来源一：此曲与1686年版《澄鉴堂琴谱》中《石上流泉》实为一曲。本传谱为一首典型的A-B-A三段体曲式结构，中段颇具山歌风且戏谑流畅的旋律、及右手指法编配特点，在琴曲中甚鲜见。
来源二：，它与其他版本所辑载的《石上流泉》有点相像，但从旋律到演奏手法，两者又有很大的区别。
《碧涧流泉》出自《古冈遗谱》，“古冈”即古代冈州（今广东新会，清时改今名）。据传南宋末年，金元入侵中原，宋朝皇室被迫从临安（今杭州）南迁福州，最后迁到冈州，1279年，冈州被破，丞相陆秀夫背负少帝赵昺在崖门投海而殁，从而结束了宋朝历史。相传《古冈遗谱》就是当时遗留下来的古琴谱。清道光年间，广东新会人黄景星（？-1842）辑编了《悟雪山房琴谱》，共收集有琴曲50首，其中大部分来自《古冈遗谱》。《碧涧流泉》就是其中的一首。
